Potrivit raportului, modul de raportare a datelor este greoi şi încărcarea lor în sistem ţine mai mult de abilităţile operatorului. De asemenea, s-a constatat că bazele de date ale sistemului conţin informaţii incomplete sau care sunt actualizate cu întârziere. În plus, există nereguli legate de verificarea calităţii de asigurat.
Raportul Curţii are şi câteva recomandări pentru îmbunătăţirea sistemului. Cele mai importante se referă la eliminarea informaţiilor legate de persoanele decedate şi la scoaterea de pe listele medicilor de familie a românilor plecaţi definitiv din ţară.