Primul seism s-a produs la ora locală 21.36 (ora 15.36, ora României), iar al doilea la 00.03 (ora 18.03 ora României). Peste 19 clădiri s-au dărâmat în orașul Mashiki, situat la 900 de kilometri sud-vest de Tokyo, iar cel puţin 45 persoane au fost rănite.
Seismul a fost urmat de un altul produs pe insula Kyushu din sudul Japoniei. Uzina Electrică Kyushu a raportat că reactoarele sale nucleare din Prefectura Kagoshima, aflată la 130 de kilometri de Kumamoto, nu au fost avariate.