În prezent, reprezentarea diplomatică şi consulară a României în Estonia este asigurată de Ambasada României în Finlanda, prin ambasadorul Cătălin Avramescu.
În România, reprezentarea diplomatică şi consulară a Republicii Estonia în România este asigurată de Ambasada Estoniei în Republica Polonă, ambasador extraordinar şi plenipotenţiar fiind E.S. Eeric MERMEI, care are reşedinţa la Varşovia.