Meciuri din preliminariile CM 2014 s-au jucat şi în America de Sud, unul dintre ele jucându-se la Santiago, între reprezentativele statelor Chile şi Argentina. Messi a fost şi de această dată providenţial, marcând primul gol al întâlnirii câştigate de argentineni cu scorul de 2-1. A fost al 68-lea gol marcat de Messi în acest an şi, totodată, al 31-lea marcat pentru echipa reprezentativă, în 75 de apariţii.
Messi este al patrulea marcator din istoria Argentinei (după Maradona, Crespo şi Batistuta) şi prin jocul său a ajuns să fie idolatrizat şi de arbitri. S-a ajuns astfel în situaţia ca la pauza meciului Chile – Argentina pentru unul dintre arbitrii paraguayeni ai întâlnirii admiraţia pentru Messi să fie mai puternică decât obiectivitatea şi profesionalismul.
Fapt nemaiîntâlnit în fotbal la acest nivel, acesta l-a oprit pe starul Barcelonei din drumul spre vestiare pentru a face o fotografie alături de acesta.